学习和工作经历
2011.6-2015.9, 江南大学,生物工程专业, 获学士学位
2015.09-2018.3, 浙江大学, 病原生物学专业, 获硕士学位
2018.07-2020.12, 南开大学医学院, 助理实验师
2020.12-至今, 南开大学医学院, 实验师
学术与社会任职
研究方向
食源致病菌的环境耐受机制
主持科研项目
主持校级实验技术研发项目1项，参与国自然面上项目3项，参与国家重点研发项目1项。
代表性论文与专利
长期从事食品安全研究，主要聚焦食源性致病菌的环境适应、耐受存活与毒力调控机制，围绕阪崎克罗诺杆菌等重要食品相关病原菌，系统开展干燥耐受、包膜稳态、脂质代谢调控及风险防控相关研究。申请人在食品安全领域积累了较为扎实的研究基础，累计发表SCI论文59篇，以第一/通讯作者发表SCI论文17篇，其中中科院一区top论文9篇，H-Index 19，i10-index 35，累计被引用1022次，申请国家发明专利8件，已授权3件。
研究的主要创新点包括：
（1）建立了基于转座子突变体系的环境应激敏感致病菌反向筛选新策略
针对传统突变筛选低效、假阳性高的底层技术瓶颈，开发了基于酸胁迫条件的高通量转座子插入突变体反向筛选新技术，显著提升了靶向突变体富集的准确性；依托该技术成功构建了覆盖膜蛋白、调控因子及代谢酶等核心功能基因的高容量突变体库，有效突破了致病基因规模化鉴定的方法学限制，相关底层核心技术获国家发明专利授权（CN112080546A）。
（2）揭示了阪崎肠杆菌耐受极端干燥环境的核心膜蛋白组分与代谢防护网络
明确了脂蛋白NlpD是阪崎肠杆菌干燥抗性与生物膜形成的关键因子，通过维持膜完整性参与应激响应；阐明了麦芽糊精结合蛋白（MBP）在干燥胁迫下的保护功能，确立了其在碳代谢与抗逆间的桥梁作用；探明了RecA与GlrK对Gig2的拮抗调控机制，建立了氧化还原稳态与干燥耐受的直接分子关联；证实了FadR介导的脂肪酸代谢是极端干燥条件下能量供应与膜功能维持的核心环节。
（3）阐明了基于蛋白质修饰与多维信号网络的毒力协同调控新机制
首次报道了分子伴侣DnaK介导的蛋白质脱酰胺化（Deamidation）修饰是阪崎肠杆菌响应应激适应和调控毒力表达的关键“开关”；证实了重组酶RecA的缺失会破坏蛋白质稳态，引发蛋白质异常脱酰胺化和氧化，进而导致糖酵解途径受损，深刻揭示了DNA修复系统与代谢/修饰网络的跨界关联；系统阐明了基于多维信号的毒力协同调控机理，发现EnvZ/OmpR双组分系统及kdpE基因是全局调控的中枢；解析了c-di-GMP介导的LprI、以及TreR和大质粒pESA3协同介导的PdxY在维持稳态及跨宿主感染中的作用。
近期成果：1) P. Lu, J. Xue, A. Shi, and X. Ji#*, Opposing regulation of Gig2 by RecA and GlrK controls redox-linked desiccation tolerance in Cronobacter sakazakii. Food Microbiol, 2025. 132: 104860. 10.1016/j.fm.2025.104860.
2) P. Lu, J. Xue, A. Shi, and X. Ji#*, Hydrophilic guardians: Putative core proteins unaltered by 22 gene deletions mediate desiccation resistance in Cronobacter sakazakii. Food Microbiol, 2025. 131: 104814. 10.1016/j.fm.2025.104814.
3) P. Lu, J. Xue, A. Shi, and X. Ji#*, Sep, a YieP homolog, orchestrates membrane remodeling and multi-stress resistance in Salmonella enterica isolates from food. Int J Food Microbiol, 2025. 442: 111385. 10.1016/j.ijfoodmicro.2025.111385.
4) P. Lu, J. Xue, A. Shi, and X. Ji#*, Fatty acid metabolism governed by FadR is essential for Cronobacter sakazakii survival in dry food matrices and neonatal infection. Food Res Int, 2025. 221(Pt 1): 117229. 10.1016/j.foodres.2025.117229.
5) P. Lu, J. Xue, A. Shi, and X. Ji#*, The GlrKR two-component system modulates virulence, environmental stress responses, and p-coumaric acid sensitivity in Cronobacter sakazakii. Food Bioscience, 2025. 107622.
6) P. Lu, J. Xue, and X. Ji#*, RecA deletion disrupts protein homeostasis, leading to deamidation, oxidation, and impaired glycolysis in Cronobacter sakazakii. Appl Environ Microbiol, 2025. 91(1): e0197124. 10.1128/aem.01971-24.
7) J. Xue, J. Lv, L. Liu, F. Duan, A. Shi, X. Ji*, and L. Ding, Maltodextrin-binding protein as a key factor in Cronobacter sakazakii survival under desiccation stress. Food Res Int, 2024. 177: 113871. 10.1016/j.foodres.2023.113871.
8) X. Ji#, A. Shi, J. Wang, B. Zhang, Y. Hu, H. Lv, J. Wu, Y. Sun, J. M. Liu, Y. Zhang, and S. Wang, EnvZ/OmpR Controls Protein Expression and Modifications in Cronobacter sakazakii for Virulence and Environmental Resilience. J Agric Food Chem, 2024. 72(33): 18697-18707. 10.1021/acs.jafc.4c04627.
9) X. Ji#, D. Fan, J. Wang, B. Zhang, Y. Hu, H. Lv, J. Wu, Y. Sun, J. Liu, Y. Zhang, and S. Wang, Cronobacter sakazakii lysozyme inhibitor LprI mediated by HmsP and c-di-GMP is essential for biofilm formation and virulence. Appl Environ Microbiol, 2024. 90(10): e0156424. 10.1128/aem.01564-24.
荣誉和奖励
2017年,研究生国家奖学金,
2018年,浙江大学优秀毕业生，浙江大学三好研究生，浙江省优秀毕业生
2025年,南开大学大型仪器优秀服务案例（第一完成人）、南开大学实验室建设与仪器设备管理成果奖（一等奖，第一完成人）
通讯地址：天津市海河教育园同砚路38号 300350
电子邮件：jixuemeng@nankai.edu.cn