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1. 奥密克戎传染力比德尔塔增37.5%:两毒株潜伏期和传染期接近
奥密克戎传染力比德尔塔到底高了多少呢?南开专家团队通过数据建模已经给出了大体的答案。据澎湃报道称,从南开大学黄森忠团队获悉,该团队通过大数据建模分析发现,奥密克戎的传染力比新冠变异株德尔塔的传染力增加了37.5%左右。
黄森忠团队截取了南非从2021年10月18日至11月28日的每日新增的确诊数据,在假设奥密克戎和德尔塔的平均潜伏期及传染期接近的情况下,启用EpiSIX做了拟合,得出以上结论。
目前从病例那里观察到感染奥密克戎和德尔塔患者的潜伏期和传染期接近,但因为奥密克戎的流行时间还较短,还需再观察。
同时黄森忠团队还对未来一个月南非的疫情发展趋势进行了预测:至2022年1月1日,南非新增确诊规模预计将达到5.1万-7.2万。值得一提的是,目前全球尚无奥密克戎变异株传染力、致病力和免疫逃逸能力等方面的系统研究数据。
对于这个新的变异毒株,中国疾控中心病毒病预防控制所所长许文波指出,应对奥密克戎,新冠疫苗目前仍然是有效的,能有效降低重症和死亡,并且可以降低感染发生规模。但针对不同变异毒株的传播力及其免疫逃避能力,疫苗的作用还有待观察。因此,第二代苗或针对新的变异株的疫苗研制、技术储备都在做。
2. 专家称现有疫苗对奥密克戎仍有效:预防重症仍有高效力
最近,全球疫情出现新情况引发关注。世卫组织已将新发现的毒株B.1.1.529定名为Omicron(奥密克戎,以第15个希腊字母命名)。世卫组织称,新冠病毒奥密克戎变异毒株很可能在世界广泛传播,全球风险等级“非常高”,新冠病例激增会在一些地区引发严重后果。
不过,根据看看新闻最新报道显示,当地时间11月29日,南非一名高级卫生专家称,现有疫苗可能对新出现的新冠变异病毒奥密克戎毒株同样有效。
曾担任南非政府前期防疫工作首席顾问的萨利姆·阿卜杜勒·卡里姆称:“根据我们了解的情况和其他需要关注的病毒变种对疫苗的反应,我们可以预期,疫苗对预防住院和重症仍有高效力,疫苗可能仍有强大保护力。”
卡里姆表示,虽然奥密克戎毒株看似传染性更强,但预防感染通常是由抗体发挥作用,而预防重症主要是T细胞免疫的任务,“所以,一些病毒即使逃过抗体免疫,却难逃过T细胞免疫”。
但有一点仍需注意,现在还不能确认感染奥密克戎毒株的患者都是轻症。
另外,近日欧洲卫生界人士也呼吁民众尽快接种新冠疫苗,因为现阶段广泛接种疫苗仍是遏制新冠病毒扩散的有效方法。
欧洲还有一些专家指出,现有疫苗对“奥密克戎”也有效。
3. 寻找COVID-19变体:新的奥密克戎变体如何被发现以及目前知道的情况
自COVID大流行初期,南非的基因组学监测网络一直在监测SARS-CoV-2的变化。这是一个宝贵的工具,可以更好地了解病毒的传播方式。2020年底,该网络检测到了一个新的病毒系,501Y.V2,后来被称为beta变体。现在,一个新的SARS-CoV-2变体已经被确认--B.1.1.529。世界卫生组织已经宣布它是一个值得关注的变体,并将其命名为奥密克戎(Omicron)。
为了帮助我们了解更多,《Conversation Africa》的Ozayr Patel请科学家们分享他们所知道的情况。
寻找背后的科学是什么?
追踪变体需要协调一致的努力。南非和英国是最早在2020年4月对SARS-CoV-2实施全国性基因组监测工作的大国。
变体的发现是通过对病毒检测呈阳性的样本进行全基因组测序来进行。这个过程包括检查获得的每一个序列与科学家们所知道的在南非和世界上传播的病毒相比是否有差异。当科学家看到多种差异时,这立即引起了关注,科学家进一步调查以确认他们所注意到的情况。
幸运的是,南非为此做了很好的准备。这要归功于国家卫生实验室服务局(NGS-SA)的公共部门实验室结果的中央储存库,与私营实验室的良好联系,西开普省的省级卫生数据中心,以及最先进的建模专业知识。
此外,南非有几个实验室可以培养和研究实际的病毒,并发现对疫苗接种或以前的感染形成的抗体能够在多大程度上中和新病毒。这些数据将使科学家们能够确定这种新病毒的特征。
与“野生型 ”或原始SARS-CoV-2相比,beta变体在人与人之间的传播效率要高得多,并引起了南非的第二波疫情。因此,它被归类为一个值得关注的变体。2021年期间,另一个被称为delta的关注变体在世界大部分地区传播,包括南非,在那里它引起了第三波疫情。
最近,基因组学监测网络成员实验室的常规测序在南非检测到一个新的病毒系,称为B.1.1.529。2021年11月中旬在豪登省收集的77个样本有这种病毒。邻国博茨瓦纳和中国香港地区也有少量的报告。据报道,香港的病例是一名来自南非的旅行者。
世界卫生组织给B.1.1.529命名为奥密克戎(Omicron),并将其归类为令人担忧的变体,就像beta和delta一样。
为什么南非会出现这种值得关注的变体?
科学家们目前对此并不清楚。当然,这似乎不仅仅是监测循环病毒的协同努力的结果。一种理论是,免疫系统高度受损的人,以及因无法清除病毒而经历长期的主动感染的人,可能是新病毒变体的来源。
这种假设是,某种程度的免疫压力(这意味着免疫反应不足以消除病毒,但却施加了某种程度的选择压力,迫使病毒进化)为新变体的出现创造了条件。
尽管为HIV感染者提供了先进的抗逆转录病毒治疗方案,但在南非,许多人的HIV疾病已经进入晚期,没有得到有效治疗。研究人员已经调查了几个临床病例,支持这一假设,但仍有许多东西有待了解。
为什么这种变体令人担忧?
科学家们认为,B.1.1.529携带某些令人担忧的突变。它们以前没有在这种组合中被观察到,而仅刺突蛋白就有30多个突变。这很重要,因为刺突蛋白是构成大部分疫苗的成分。此外,B.1.1.529的遗传特征与其他变体非常不同。它似乎不是delta的女儿或beta的孙子,而是代表了SARS-CoV-2的一个新系。
它的一些基因变化已从其他变体中得知,研究人员知道它们可以影响传播性或允许免疫逃避,但许多是新的特征,尚未被研究。虽然研究人员可以做出一些预测,但他们仍在研究这些突变会在多大程度上影响其行为。
研究人员想知道病毒的传播性、疾病的严重程度以及在接种疫苗或康复者中逃避免疫反应的能力。研究人员正在以两种方式研究这个问题。
首先,仔细的流行病学研究试图找出新谱系是否显示出传播性、感染疫苗或先前感染者的能力等方面的变化。
同时,实验室研究会检查病毒的特性。它的病毒生长特性与其他病毒变体的病毒生长特性进行比较,并确定该病毒能在多大程度上被疫苗接种者或康复者的血液中发现的抗体中和。
最后,当考虑到所有这些不同类型的研究结果时,在B.1.1.529中观察到的基因变化的全部意义将变得明显。这是一项复杂、艰巨和昂贵的工作,将持续数月,但对于更好地了解该病毒和制定最佳的防治策略是必不可少的。
早期的迹象是否表明这种变体会导致不同的症状或更严重的疾病?
目前还没有证据表明有任何临床差异。目前已知的是,B.1.1.529感染病例在豪登省迅速增加,该国的第四波疫情似乎正在那里开始。这表明易传播性,尽管在非药物干预措施大大放松和病例数量较少的背景下。因此,研究人员还不能确定B.1.1.529是否比以前流行的变种delta的传播效率更高。
COVID-19更有可能在老年人和慢性病人中表现为严重的、常常危及生命的疾病。但首先接触到新病毒的人群往往是年轻的、流动的、通常健康的人。如果B.1.1.529进一步传播,需要一段时间才能评估其在疾病严重程度方面的影响。
幸运的是,到目前为止,似乎所有已经检查过的诊断测试都能够识别这种新病毒。
更妙的是,一些广泛使用的商业检测方法似乎显示出一种特定的模式:三个目标基因组序列中的两个是阳性的,但第三个却不是。这就像新的变体在现有的测试中始终能在三个方框中选中两个。这可以作为B.1.1.529的标记,这意味着研究人员可以快速估计每天和每个地区由于B.1.1.529感染造成的阳性病例的比例。这对于几乎实时监测病毒的传播是非常有用的。
目前的疫苗是否可能抵御新的变体?
同样,研究人员对此也不清楚。已知的病例包括曾经接种过疫苗的人。然而,研究人员已经了解到,接种疫苗所提供的免疫保护会随着时间的推移而减弱,对感染的保护作用不大,而是对严重疾病和死亡的保护。已经开始的流行病学分析之一是研究有多少接种疫苗的人感染了B.1.1.529。
最终,迄今为止关于B.1.1.529的所有信息都突出表明,普及疫苗接种仍然是应对严重的COVID-19的最佳选择,并且与非药物干预措施一起,将在很大程度上帮助医疗系统应对即将到来的新一波疫情。
原标题:【新冠病毒】奥密克戎传染力比德尔塔增37.5%:两毒株潜伏期和传染期接近;专家称现有疫苗对奥密克戎仍有效:预防重症仍有高效力