来源于生物通公众号
当研究人员将SARS-CoV-2病毒Omicron变种的关键突变与13个适应了老鼠的毒株进行比较时，他们发现它们有多达5个共同突变。这使得作者们认为Omicron可能在老鼠宿主中进化并积累了突变。
OMICRON和小鼠适应的SARS-COV-2毒株之间共有的5个关键突变
2021年11月，世界卫生组织将SARS-CoV-2变种B.1.1.529命名为“Omicron”，并将其指定为大流行开始以来出现的第5个令人担忧的变种(VOC)。
随着Omicron病毒的迅速传播，以及它在许多国家成为该病毒的主要毒株，科学家们一直渴望了解更多关于该变种及其起源的信息。虽然他们能够确定Omicron是由2020年年中流行的一种毒株发展而来，但他们无法追踪到Omicron进化到目前形式的任何中间版本。一种观点认为，Omicron病毒感染了一种动物，并在该动物群体中传播时出现了突变，然后再转移到人类身上。
近日，《生物安全与生物安保》杂志（Journal of Biosafety and Biosecurity）在线发表了南开大学公共卫生与健康研究院院长、中国疾病预防控制中心徐建国院士，南开大学公共卫生与健康研究院孙亚民教授团队关于Omicron变异株的分析论文，题目是“Origin and evolutionary analysis of the SARS-CoV-2 Omicron variant”。
文章从进化地位和突变模式等方面分析了新冠变异株Omicron的特征，对Omicron变异株的多个小鼠适应性相关的突变位点深入剖析。作者认为Omicron变异株可能是在鼠宿主中进化后回传给人类的。作者的研究为Omicron动物性来源提供了更多的数据支持，也为新冠病毒肺炎疫情的源头防控以及未来新发突发动物源性传染病的主动防控提供重要参考。
徐教授说，虽然在这个理论被证实之前还有很多工作要做，“我们的研究计算了五种VOC中突变的平均突变数量，并调查了病毒S蛋白的关键突变，即感染发生的起源。我们发现Omicron变异在该蛋白的5个关键位点存在突变：K417、E484、Q493、Q498和N501。
这种突变谱特征表明，病毒已经适应了感染老鼠的细胞。此外，按时间比例排列的系统发育树显示，Omicron和Gamma谱系可能在2020年中期流行，这支持了Omicron可能在非人类动物物种中进化的假设。我们认为，冠状病毒随着时间的推移在老鼠体内缓慢积累突变，然后通过反向人畜共患病传播回人类。”
他补充说:“这些发现表明，研究人员应该专注于从野生动物，特别是啮齿动物中分离出的SARS-CoV-2变异。如果Omicron被确定是来自老鼠，那么它在非人类宿主中传播的影响将对该流行病的防控带来新的挑战。”
参考文献：Origin and evolutionary analysis of the SARS-CoV-2Omicron variant